Hovedforskjellen mellom kjernefusjon og fisjon er at kjernefusjon er kombinasjonen av to eller flere atomer for å skape ett stort atom, mens kjernefisjon er oppdelingen av et større atom i to eller mindre atompartikler.
I fysikk har en handling alltid en lik, men motsatt reaksjon. Dette er den ultimate filosofien i fysikk; derved har alle hendelser og handlinger alltid en motsatt reaksjon. Videre er dette også hovedkjernen i kjernefusjon og kjernefysisk reaksjon. Dette er to forskjellige typer reaksjoner som frigjør visse mengder energi. I enkel kjemi skaper den ene mindre atomer mens den andre kombinerer atomer for å danne en større.
