Hovedforskjellen mellom septat og aseptat hyfer er at septat hyfer har septa eller tverrvegger som deler hyfer i forskjellige celler mens aseptat hyfer mangler septa.
Hyfer er lange filamenter eller trådlignende strukturer av sopp. Hyfer representerer den vegetative strukturen til sopp. Mycelium er samlingen av hyfer av en sopp. Sopphyfer består av celler omgitt av en cellevegg laget av kitin. For å skille celler i hyfene, er det perforerte tverrvegger som kalles septa. Men septa er ikke tilstede i hyfer av alle sopper. Derfor, basert på tilstedeværelsen og fraværet av septa, har hyfer to typer: septathyfer og aseptathyfer.
