Hovedforskjellen mellom zooidogamy og sifonogami er at zooidogamy er en tilstand der mannlige kjønnsceller svømmer i vannet for å nå sine kvinnelige kjønnsceller mens sifonogami er en tilstand der pollenrør er utviklet for å føre mannlige kjønnsceller til kvinnelige kjønnsceller.
Seksuell reproduksjon skjer på forskjellige måter blant forskjellige grupper av planter. For å fullføre befruktningen, bør mannlige kjønnsceller nå kvinnelige kjønnsceller. Zooidogamy og sifonogami er to måter som forklarer hvordan mannlige kjønnsceller reiser mot kvinnelige kjønnsceller. I zooidogamy svømmer mannlige kjønnsceller mot kvinnelige kjønnsceller mens i sifonogami reiser mannlige kjønnsceller gjennom et pollenrør mot kvinnelige kjønnsceller. For eksempel utviser alger, bryofytter, pteridofytter og noen gymnospermer zooidogami mens frøplanter viser sifonogami.
