Hovedforskjellen mellom kromosombånding og kromosommaling er at kromosombånding er en fargeteknikk som viser områder av kromosomer i skille mørke og lyse bånd, men kromosommaling er en hybridiseringsteknikk der spesifikke regioner eller segmenter av kromosomer er malt med sekvensspesifikk fluorescerende merkede prober.
I cytogenetikk er det nødvendig å produsere en synlig karyotype av en organisme for å identifisere kromosomer og deres avvik. Kromosombånding og kromosommaling er to cytogenetiske teknikker som hjelper til med å visualisere kromosomer. Begge teknikkene er nyttige for å identifisere genetiske lidelser.