Hovedforskjellen mellom mesoderm og mesenchyme er at mesoderm er et av de tre kimlagene av bilateralt symmetriske dyr, mens mesenchyme er et udifferensiert vev som finnes i embryonal ekte mesoderm.
Hos diploblastiske dyr er kroppsplanen relativt enkel med to lag celler. De to lagene er den ytre ektoderm og den indre endoderm. Ektodermcellene vender mot miljøet, og endodermcellene vender mot enteronet, som er et hulrom med en enkelt åpning mot utsiden. Åpningen er munnen. Videre er triploblastisk tilstand tilstanden der et tredje lag kjent som mesoderm utvikles i embryoet. Mesoderm ligger mellom ektoderm og endoderm, og skiller de to cellelagene. Det tredje laget er viktig for kroppen. Hos visse dyr forblir mye av mesoderm udifferensiert og danner et pakningsvev kjent som mesenkymet, som støtter og beskytter kroppens organer.
