Hovedforskjellen mellom NAG og NAM er at N-acetylglukosamin (NAG) ikke har et pentapeptid festet til det mens N-acetylmuraminsyren (NAM) har et pentapeptid festet til seg.
Peptidoglykan er unik for bakterier, og det er komponenten som er tilstede i bakteriecelleveggen. I bakteriecelleveggen er det et lag av peptidoglycan. Basert på tykkelsen på dette laget, skiller bakterier seg i to hovedgrupper som er viktige i bakteriekarakterisering. I Grams-positive bakterier er det et tykt peptidoglycan-lag, mens det i Grams-negative bakterier er et tynt peptidoglycan-lag. Peptidoglycan er en polymer sammensatt av sukker og aminosyrer. N-acetylglukosamin (NAG) og N-acetylmuraminsyre (NAM) er to alternerende aminosukkere som er tilstede i peptidoglycan-laget av bakteriecelleveggen.