Hovedforskjellen mellom rhizom og stolon er at rhizom er den rotlignende hovedstammen som vokser under jorden, mens stolon er en stilk som er spiret fra den eksisterende stammen som går horisontalt rett under jordoverflaten for å danne en ny plante og få kontakt med moderplanten.
Rhizomes og stolons er spesielle strukturer av planter. De er avgjørende i vegetativ reproduksjon. Begge delene kan også lagre mat. Ikke bare det, begge hjelper planter å overleve under tøffe miljøforhold. Strukturelt er de stengler. Rhizomet er hovedstammen som ligger under jorden mens stolon er en stamme som er spiret fra hovedstammen som går horisontalt på bakken.