Hovedforskjellen mellom fenetikk og kladistikk er metoden som brukes i klassifisering av organismer. Fenetikk klassifiserer organismer basert på morfologiske og strukturelle trekk, mens kladistikk klassifiserer organismer basert på deres forfedre og evolusjonære forhold.
Klassifisering av organismer er en viktig prosess i biologisk mangfold og biologiske studier. Taksonomi letter klassifiseringen av ulike systemer samtidig som det hjelper til med gruppering og gruppering av organismer. I denne forbindelse spiller fenetikk og kladistikk en viktig rolle i å bygge relasjoner mellom organismer.
