Hovedforskjellen mellom vernalisering og stratifisering er at vernalisering er en behandling som brukes til å fremme blomsterinitiering, mens stratifisering er en behandling som brukes til å bryte frødvalen.
Vernalisering og stratifisering er to viktige teknikker knyttet til planter. Vernalisering akselererer tidlig blomstring mens stratifisering bryter frødvalen. Dermed er begge typer teknikker like nyttige i landbruket. Videre involverer begge prosesser kalde behandlinger. Bortsett fra det, innebærer stratifisering også varme forhold.