Hovedforskjellen mellom allelopati og antibiose er basert på hvilken type effekt hvert fenomen medfører. Allelopati gir både positive og negative effekter på forholdet mellom to eller flere organismer, mens antibiose medfører negative effekter på en av organismer som er involvert i forholdet.
Ernæring spiller en viktig rolle i organismenes overlevelse. I den sammenheng er forholdet mellom organismer for næringsbehovet avgjørende. Både allelopati og antibiose er forhold som finner sted mellom to eller flere organismer. Imidlertid svarer de på hverandre i forskjellige former.