Hovedforskjellen mellom dynein og kinesin er at dynein er et cytoskjelettmotorprotein som beveger seg mot minusenden av mikrotubuli mens kinesin er et annet cytoskjelettmotorprotein som beveger seg mot plussenden av mikrotubuli.
Cytoskjelettet består av forskjellige typer filamenter. Mikrotubuli er en type blant dem. De styrer den materielle bevegelsen i cellen. De er også viktige for å opprettholde celleformen. Bortsett fra det, er mikrotubuli avgjørende for å skille kromosomer i mitose og meiose. Videre er mikrotubuli nøkkelkomponenter i cilia og flagella i noen eukaryote celler. Strukturelt er mikrotubuli polære strukturer. De har en pluss slutt og minus slutt. Generelt strekker minusenden seg mot sentrum av cellen mens plussenden strekker seg mot celleoverflaten. Under den intracellulære transporten av vesikler og organeller, hjelper to typer motorer med cytoskelett, mikrotubuli. De er dyneiner og kinesiner. Dyneiner beveger seg mot minusenden av mikrorørene mens de bærer materialer til sentrum av cellen. Derimot beveger kinesiner seg mot celleoverflaten og bærer materialer til periferien av cellen.
