Hovedforskjellen mellom fucoidan og fucoxanthin er at fucoidan er et fucoseholdig sulfatert polysakkarid som er tilstede i forskjellige arter av brunalger og brun tang, mens fucoxanthin er en xantofyll som er tilstede som tilbehørspigment i kloroplaster av brunalger og andre heterokonter.
Marine økosystemer består av både flora og fauna. De har et stort mangfold av arter. Dessuten inneholder disse artene forskjellige forbindelser som er gunstige for mennesker. Biomolekylene ekstrahert fra disse artene i marine økosystemer inneholder forskjellige terapeutiske potensialer. Fucoidan og fucoxanthin er to slike forbindelser som finnes i marine økosystemer, hovedsakelig i brune alger. Selv om de er forskjellige kjemisk, brukes begge forbindelser for øyeblikket for forskjellige forskningsformål for å identifisere potensialet som terapi.