Hovedforskjellen mellom sekretin og kolecystokinin er at sekretinet er et peptidhormon produsert av S-celler i tolvfingertarmen og jejunum mens kolecystokinin er et annet peptidhormon utskilt av I-celler i tolvfingertarmen.
Hormoner er kjemikalier syntetisert av endokrine kjertler. De regulerer de fleste kroppsfunksjonene. Videre skiller forskjellige typer organer ut forskjellige hormoner. Blant de forskjellige organene er mage-tarmkanalen et organ som utskiller hormoner som er essensielle for matfordøyelsen og relaterte funksjoner. Ulike deler av mage-tarmkanalen utskiller også hormoner. Videre utskiller tolvfingertarmen også flere essensielle hormoner. Blant dem er sekretin og kolecystokinin to hormoner som produseres og skilles ut når mat når magen. Begge hormonene er peptidhormoner som er ansvarlige for å regulere magesekresjoner og opprettholde et alkalisk miljø i tolvfingertarmen.