Hovedforskjellen mellom klorofyll A og B er at klorofyll A er det primære fotosyntetiske pigmentet i planter og alger, mens klorofyll B er et tilbehørspigment som samler energi og overføres til klorofyll A.
Klorofyll er en familie av naturlige pigmenter som er tilstede i planter og alger og er ansvarlig for deres grønne farge. Klorofyll absorberer energi fra sollys og bruker denne energien til å syntetisere karbohydrater fra vann og karbondioksid. Det er prosessen som kalles fotosyntese som opprettholder livsprosesser i alle planter ettersom energibehovene deres blir oppfylt gjennom denne prosessen. Videre er fotosyntese den viktigste prosessen som opprettholder alle levende organismer, siden planter er de viktigste produsentene av alle næringskjeder. Dyr og mennesker spiser produkter av planter. I klorofyllpigmentfamilien er det flere typer klorofyllpigmenter. Blant dem er klorofyll A og klorofyll B to typer klorofyll. De har en lignende struktur med en liten forskjell i porfyrinringen. Klorofyll A har CH3 grupper i porfyrinringen mens klorofyll B har en CHO (aldehydgruppe) i porfyrinringen.