Hovedforskjellen mellom auxin og cytokinin er at auxin stimulerer rotforgrening mens cytokinin hemmer rotforgrening og lateral rotdannelse. For å legge mer til dette er auxin hovedsakelig ansvarlig for forlengelse av celler i stammen og rotspissene, mens cytokininer hovedsakelig er ansvarlige for celledeling, og de finnes derfor i voksende områder.
Fytohormoner, også kjent som plantehormoner, er viktige kjemiske stoffer for plantevekst og utvikling. De er organiske molekyler, og de fungerer som signalmolekyler som regulerer planteutviklingen. Det er fem hovedtyper av plantehormoner: auxin, gibberellin, cytokinin, etylen og abscisinsyre. Dermed utfører de forskjellige funksjoner alene og sammen for å påvirke planteveksten.
