Hovedforskjellen mellom Cosmid og Phagemid er på typen sekvenser den inneholder. Et kosmid inneholder et cos-sted og et plasmid. Derfor er det en hybridvektor mens et fagemid er et plasmid som inneholder et F1-replikasjonsopprinnelse av F1-fagen.
Kosmider og fagemider brukes til kloning, spesielt for å klone større fragmenter av DNA. Disse brukes mye, spesielt i kloning av gener som er ansvarlige for produksjonen av forskjellige proteiner. Kosmider og fagemider replikeres enten alene som plasmider eller pakkes i viruspartikler og replikeres deretter.
