Hovedforskjellen mellom contig og stillas er at en contig ikke har hull mens et stillas består av contigs og hull.
Genomsekvensering av flercellede organismer er veldig vanskelig sammenlignet med sekvensering av encellede organismer. Hele-genom haglgeværsekvensering er en enkel og rask genom-sekvenseringsteknikk for flercellede genomer. Det er en metode som sekvenserer mange overlappende DNA-fragmenter parallelt. I denne metoden blir små fragmenter samlet i større fragmenter og deretter i større kontiger ved hjelp av en datamaskin. Deretter samles kontigene i stillaser og til slutt i et kromosom. Derfor er contig en kontinuerlig strekning av nukleotidsekvenser mens stillaset er en del av genomet som består av kontig og hull. Både contig og stillas er rekonstruerte genomiske sekvenser.
