Hovedforskjellen mellom allozymer og isozymer er at allozymer er kodet av forskjellige alleler på samme sted. Men derimot er isozymer kodet av gener på forskjellige steder.
Enzymer er biokatalysatorer som fremskynder biokjemiske reaksjoner. Faktisk er de proteinmolekyler kodet av gener. Det finnes forskjellige typer enzymer. Noen enzymer er kodet av forskjellige alleler av samme gen som er tilstede på samme sted. De er kjent som allozymes. I kontrast er noen enzymer kodet av forskjellige gener lokalisert på forskjellige steder. Disse enzymene er kjent som isozymer. Isozymer og allozymer kan brukes til å bestemme forholdet mellom to organismer.
