Hovedforskjellen mellom eksencephaly og anencephaly er at exencephaly er en cephalic lidelse der hjernevevet er plassert utenfor skallen på grunn av fravær av kranial hulrom og hodebunn. I mellomtiden er anencefali en cefalisk lidelse som er preget av fraværet av en stor del av hjernen, hodeskallen og hodebunnen på grunn av svikt i den rostrale nevroporen.
Medfødte lidelser oppstår på grunn av nevrale defekter som finner sted under graviditet. De gir opphav til en høy grad av dødelighet, noe som gjør tilstanden dødelig. Eksencephaly og anencephaly er to slike medfødte lidelser så vel som cephalic lidelser sett hos spedbarn. I eksencephaly, er hjernen plassert utenfor skallen. I anencefali er en stor del av hjernen, hodeskallen og hodebunnen fraværende. Exencephaly anses å være en embryologisk forløper for anencefali. Imidlertid er eksencephaly ekstremt en sjelden tilstand sammenlignet med anencephaly.
