Hovedforskjellen mellom chemoorganotrophs og chemolithotrophs er at chemoorganotrophs er organismer som får elektroner fra organiske forbindelser, mens chemolithotrophs er organismer som får elektroner fra uorganiske forbindelser.
Levende organismer kan grupperes i flere kategorier i forhold til ernæringsmodus basert på energikilden og karbonet. Det er energikilder som sollys og organiske forbindelser. På samme måte er det to typer kilder til karbon som uorganisk karbon og organisk karbon. De fire hovedkategoriene er fotoautotrofer, fotoheterotrofer, kjemoautotrofer og kjemoheterotrofer. Videre, basert på den primære kilden til reduserende ekvivalent, er det to kategorier som organotrofer og litotrofer. Chemoorganotrophs og chemolithotrophs er to grupper som bruker energi fra å bryte kjemiske forbindelser. Men de skiller seg fra hverandre basert på elektrondonoren. Kilden til elektrondonor er organiske forbindelser i chemoorganotrophs mens kilden til reduserende ekvivalent er uorganisk i chemolithotrophs.