Hovedforskjellen mellom DNA-RNA-hybrider og dsDNA er at DNA-RNA-hybrider er dobbeltstrengede nukleotider sammensatt av en DNA-streng og en komplementær RNA-streng, mens dsDNA er et dobbeltstrenget DNA som består av to komplementære DNA-tråder.
I sin opprinnelige tilstand er DNA dobbeltstrenget. Den har to komplementære DNA-tråder bundet via hydrogenbindinger. RNA er enkeltstrenget i sin opprinnelige struktur. I noen tilfeller danner RNA duplekser med DNA. De er kjent som DNA-RNA-hybrider. De dannes hovedsakelig under transkripsjon og multiplikasjon av onkogene RNA-virus. I forhold til dsDNA er DNA-RNA-hybrider mer stabile.
