Hovedforskjellen mellom kimære og mosaikk er antall zygoter involvert i dannelsen av hver organisme. Ulike cellepopulasjoner stammer fra to zygoter i kimære mens forskjellige cellepopulasjoner stammer fra en enkelt zygote i mosaikk.
Chimera og mosaikk var opprinnelig mytiske begreper om genetisk kombinasjon. Men med fremskrittet for genetikk og molekylærbiologi har det nå vært mulig å vitenskapelig forklare fenomenene kimerisme og mosaikk. I både kimerisme og mosaikk har noen av kroppens celler et annet genom. Dermed kan det samme vevet inneholde to eller flere forskjellige cellepopulasjoner. Videre deltar to zygoter i dannelsen av et embryo som utvikler seg til kimær mens en enkelt zygote deltar i dannelsen av et embryo som utvikler seg til mosaikken. Mutasjon i tidlig utvikling er årsaken til mosaikk, mens involvering av to forskjellige zygoter er årsaken til kimerisme.
