Hovedforskjellen mellom pattedyr og reptil er at pattedyr er et varmblods virveldyr som kan regulere den indre kroppstemperaturen mens reptil er et kaldblods virveldyr som ikke kan opprettholde konstant kroppstemperatur.
Vertebrater er dyr som har en ryggrad eller en ryggsøyle. De kan være varmblodige eller kaldblodige. Varmblodige dyr kan regulere kroppens indre temperatur mens de kaldblodige dyrene ikke kan regulere konstant kroppstemperatur. Derfor svinger kroppstemperaturen i henhold til det ytre miljøet.
Det er fem hovedgrupper av virveldyr, nemlig fisk, amfibier, reptiler, fugler og pattedyr. Blant dem er fugler og pattedyr varmblodige mens fisk, amfibier og reptiler er kaldblodige. Når vi vurderer pattedyrene og reptilene, er begge virveldyr som oksygen puster og trenger næring for de levende. Begge har også de samme organkomponentene som hjerne, hjerte, mage, lunger, etc. Videre er pattedyrene og reptilene begge tetrapoder, noe som betyr at de begge har fire lemmer. Selv om dette er noen likheter mellom begge, er det også mange forskjeller mellom pattedyr og reptil.
