Hovedforskjellen mellom vakuoler og vesikler er at vakuolene er store membranbundne sekker som brukes som lagring, mens vesiklene er små membranbundne sekker som brukes som lagring og å transportere inne i de eukaryote cellene.
En celle er som en pose med kjemikalier, som er i stand til å overleve og replikere seg selv. Cellemembranen skiller celleinteriøret fra det ytre miljøet i dyreceller. Derfor er celleveggen i planteceller den ytre grensen som skiller celleinteriøret fra det ytre miljøet. Generelt inneholder en celle forskjellige typer organeller i cytoplasmaet. Disse organellene inkluderer kjernen, Golgi-apparatet, mitokondrier, endoplasmatisk retikulum, ribosomer, sentrioler, vesikler, etc.