Hovedforskjellen mellom glyoksysomer og peroksisomer er at glyoksysomer bare er til stede i planteceller og filamentøse sopp, mens peroksisomer er tilstede i nesten alle eukaryote celler. Glykoksysomer er rikelig i planteceller av spirende frø mens peroksisomer er rikelig i lever- og nyreceller.
Disse to organellene er mikrolegemer som er tilstede i eukaryote celler. Glykoksysomer er spesialiserte peroksisomer som bare finnes i planteceller og filamentøse sopp. Peroksisomer er organeller som hjelper til med å bryte ned lange fettsyrekjeder og avgifte cellen. De nedbryter alkoholer og andre skadelige forbindelser.
