Nøkkelforskjell - VNTR vs STR
DNA-studier har enorm nytte for å forstå og bestemme fylogenetiske forhold, diagnostisere genetiske sykdommer og kartlegge organismens genomer. Flere teknikker assosiert med DNA-analyse brukes til identifisering av et bestemt gen eller en DNA-sekvens i en pool av ukjent DNA. De er kjent som genetiske markører. Genetiske markører brukes i molekylærbiologi for å identifisere genetisk variasjon mellom individer og arter. Variabel antall tandemrepetisjon (VNTR) og kort tandemrepetisjon (STR) er to typer genetiske markører som viser polymorfisme blant individer. Begge typene er ikke-kodende repeterende DNA som gjentas av tandem. De er ordnet i mot-til-hale mote i kromosomer. VNTR er en del av genomet der kort nukleotidsekvens gjentas flere ganger. STR er en annen del av DNA i genomet som er organisert som gjentakende enheter som består av to til tretten nukleotider på hundre ganger. Hovedforskjellen mellom VNTR og STR er antall nukleotider i en gjentatt sekvens. Gjentatte enheter av VNTR består av 10 til 100 nukleotider, mens gjentatte enheter av STR består av 2 til 13 nukleotider. VNTR og STR brukes mye i rettsmedisinske studier.
INNHOLD
1. Oversikt og
nøkkelforskjell 2. Hva er VNTR
3. Hva er STR
4. Likheter mellom VNTR og STR
5. Sammenligning side om side - VNTR vs STR i tabellform
6. Sammendrag
Hva er VNTR?
En tandemrepetisjon er en kort DNA-sekvens som gjentas mot hode til hale på et spesifikt kromosomalt sted. Det er ingen annen sekvens eller nukleotid i tandemrepetisjonen. Det er flere typer tandemgjentakelser i genomet. VNTR er en type tandemrepetisjon blant dem som har gjentatte enheter som består av 10 til 100 nukleotider. VNTR er en type minisatellitt. Disse tandemgjentakelsene finnes i mange kromosomer. De er ispedd i det menneskelige genomet og ligger overveiende i de subtelomere områdene av kromosomer.
VNTR viser tandem gjentatt polymorfisme blant individer. Lengden på VNTR på en bestemt plassering av kromosomet er svært variabel blant individer på grunn av variasjonen i antall repeterende enheter organisert i den DNA-seksjonen. Derfor kan VNTR brukes som et kraftig verktøy for identifisering av individer, og VNTR-analyse brukes på mange felt, inkludert genetikk, biologiforskning, rettsmedisin og DNA-fingeravtrykk. VNTR var de første genetiske markørene som ble brukt til å kvantifisere implantasjon av benmargstransplantasjon. VNTR var også de første polymorfe markørene som ble brukt i DNA-profilering i rettsmedisin.
Figur 01: Variasjon av VNTRs i seks individer
VNTR-analyse utføres via restriksjonsfragmentlengde polymorfisme etterfulgt av sørlig hybridisering. Derfor trenger den forholdsvis en stor DNA-prøve. VNTR-profiltolkning er også problematisk. På grunn av disse begrensningene har bruken av VNTR i rettsmedisinsk genetikk vært begrenset, og den erstattes av STR-analyse.
Hva er STR?
STR er en svært repeterende DNA-seksjon som består av to til tretten nukleotid-repeterende enheter organisert på en tandem måte. STR ligner på VNTR. Men det varierer fra VNTR fra antall nukleotider i en gjentatt sekvens og antall gjentakelser. STR er en type mikrosatellitt.
STR-analyse involvert i å måle det nøyaktige antall repeterende enheter. STR er svært varierende blant individer, i likhet med VNT. STR-profiler er forskjellige fra person til person. Derfor brukes STR-analyse i molekylærbiologi for å sammenligne spesifikke steder på DNA fra to eller flere prøver. Derfor blir STRs betraktet som kraftige genetiske markører i molekylærbiologi. Det gir et utmerket verktøy for identifisering av individer på grunn av deres høye grad av polymorfisme og relativt kort lengde.
For tiden er STRs det mest brukte analyserte genetiske polymorfismeverktøyet i rettsmedisinsk genetikk. De fleste rettsmedisinske saksarbeid involverer STR polymorf analyse. STR loci er spredt over hele genomet. Det er tusenvis av STRs plassert i kromosomer som kan brukes i rettsmedisinsk analyse. STR-analyse involverer ikke begrensningslengdepolymorfisme som VNTR-analyse. STR-analyse kutter ikke DNA med restriksjonsenzymer. Spesifikke sonder brukes til å feste ønskede regioner på DNA og ved bruk av PCR-teknikk bestemmes lengdene på STR.
Figur 02: STR-variasjon mellom prøvene
Hva er likhetene mellom VNTR og STR?
- VNTR og STR er ikke-kodende DNA.
- Begge er tandemgjentakelser.
- Begge viser polymorfisme blant individer på grunn av forskjellen i lengden på DNA-seksjonen.
- Begge brukes som kraftige genetiske markører i DNA-fingeravtrykk og i rettsmedisinske studier.
Hva er forskjellen mellom VNTR og STR?
Diff Article Midt før tabell
VNTR vs STR |
|
| VNTR er et ikke-kodende repeterende DNA som har en kort nukleotidsekvens gjentatt på en tandem måte. | STR er en svært repeterende DNA-seksjon som består av to til tretten nukleotid-repeterende enheter organisert på en tandem måte. |
| Størrelse | |
| VNTR er større enn STR. | STR er mindre enn VNTR. |
| Antall nukleotider i gjentatt sekvens | |
| Den gjentatte enheten til VNTR består av 10 til 100 nukleotider. | Den gjentatte enheten av STR består av 2 til 13 nukleotider. |
Sammendrag - VNTR vs STR
VNTR og STR er to kraftige genetiske markører brukt i molekylærbiologi, spesielt innen rettsmedisinsk genetikk. VNTR er en type minisatellitt og STR er en mikrosatellitt. VNTR og STR er ikke-kodende, svært repeterende DNA. De er tandemgjentakelser. Den generelle strukturen til VNTR og STR er den samme. Imidlertid er antall nukleotider i den gjentatte sekvensen og lengden forskjellig. VNTR har gjentatte sekvenser består av 10 til 100 nukleotider. STR har gjentatte sekvenser bestående av 2 til 13 nukleotider. Dette er forskjellen mellom VNTR og STR.
Last ned PDF-versjon av VNTR vs STR
Du kan laste ned PDF-versjonen av denne artikkelen og bruke den til frakoblede formål i henhold til sitater. Last ned PDF-versjon her Forskjellen mellom VNTR og STR.
