Hovedforskjellen mellom likhet og identitet i sekvensjustering er at likhet er likhet (likhet) mellom to sekvenser i sammenligning, mens identitet er antall tegn som samsvarer nøyaktig mellom to forskjellige sekvenser.
Bioinformatikk er et tverrfaglig vitenskapsfelt som hovedsakelig involverer molekylærbiologi og genetikk, informatikk, matematikk og statistikk. Sekvensjustering er et viktig begrep innen bioinformatikk. Det er prosedyren der sekvensene av DNA, RNA eller protein er ordnet for å identifisere regioner av likhet som er en konsekvens av funksjonell, strukturell eller evolusjonær sammenheng mellom sekvensene. På slutten av justeringen vil de bli presentert som rader i en matrise. For å justere de identiske tegnene i påfølgende farger, er det satt inn mellomrom mellom restene.
