Hovedforskjellen mellom sopp og parasitter er at sopp er en gruppe eukaryote saprotrofiske organismer, inkludert gjær, mugg og sopp, mens parasitter er en gruppe organismer som lever på eller inne i en annen organisme og får næringsstoffer.
Både sopp og parasitter forårsaker forskjellige sykdommer hos mennesker. Ikke bare hos mennesker, men parasitter forårsaker også sykdommer hos andre dyr og planter. Parasitter er organismer som viser en livsstil som kalles parasittisme. Parasitisme er en av tre typer symbiotiske forhold som eksisterer mellom to eller flere arter som lever sammen. Visse sopparter, noen insekter, protozoer og helminter er eksempler på parasitter. I parasittisme lever parasittene på eller inne i en annen organisme som kalles vert; parasittisme gir bare fordeler med parasitt mens det forårsaker sykdommer for verten. Dessuten kan parasitter ikke overleve uten vertene.