Hovedforskjellen mellom motorisk og sensorisk homunculus er typen behandling hver gjennomgår under nevrologisk kartlegging. Motor homunculus er et kart som viser motorbehandlingen av de forskjellige anatomiske delene av kroppen mens sensorisk homunculus er et kart som viser sensorisk prosessering av de forskjellige anatomiske delene av kroppen.
Homunculus er et imaginært kart generert på dataene som er tilgjengelige på de forskjellige nevrologiske forbindelsene. Det involverer hovedsakelig hjernen, sensorisk prosessering og motorbehandling. Videre spiller nerver og ryggmargen også en viktig rolle i å generere homunculus.
