Hovedforskjellen mellom lysosomer og ribosomer er at lysosomene er cellesteder for nedbrytende søppel, mens ribosomene er cellesteder for syntetisering av proteiner.
En celle har forskjellige komponenter, og disse komponentene spiller forskjellige roller i cellen som hjelper overlevelsen til levende organismer. Blant de forskjellige cellekomponentene er lysosomer og ribosomer to viktige cellekomponenter. Disse to strukturene oppfyller to forskjellige funksjoner i cellen. Derfor er begge viktige for cellefunksjon. Lysosomer inneholder en rekke fordøyelsesenzymer som hjelper til med å nedbryte de uønskede tingene som er samlet i cellen. På den annen side er ribosomer essensielle i proteinsyntese. Selv om de er essensielle cellekomponenter, er lysosomer bare til stede i eukaryote celler mens ribosomer er til stede i både eukaryote og prokaryote celler.