Hovedforskjellen mellom mannlig og kvinnelig urinrørsanatomi er at den mannlige urinrøret er lengre mens den kvinnelige urinrøret er kortere i strukturen. Også, i motsetning til kvinnelig urinrør, er den mannlige urinrøret en kompleks struktur og har underdeler.
I anatomi refererer urinrøret til den funksjonelle kanalen, som er ansvarlig for å transportere urin fra blæren til det ytre. Det er tilstede hos både menn og kvinner. Den urinrørhannen har imidlertid lengre struktur siden den er ansvarlig for å transportere sæd så vel til utsiden i tillegg til urin. I motsetning til dette har den kvinnelige urinrøret kortere struktur og transporterer bare urin til utsiden. På grunn av forskjellen i den anatomiske strukturen til den mannlige og den kvinnelige urinrøret, endres også de funksjonelle egenskapene til hannen og den kvinnelige urinrøret. Derfor er det viktig å studere forskjellen mellom mannlig og kvinnelig urinrørsanatomi i urologiske studier.