Hovedforskjellen mellom geografisk og reproduktiv isolasjon er at den geografiske isolasjonen er en kategori av reproduktiv isolasjon som refererer til separasjon av populasjoner av organismer fra parring eller utveksling av genetisk materiale ved fysiske grenser, mens reproduktiv isolasjon refererer til et sett med mekanismer som forhindrer arter fra parring og å produsere fruktbare avkom.
Befruktning er foreningen av en sædcell og et egg for å danne en diploid zygote under seksuell reproduksjon. Hvis den produserte zygoten er moden, vil den til slutt vokse til et sunt fruktbart avkom. reproduktiv isolasjon er derfor en prosess som forhindrer dannelsen av et fruktbart avkom. Denne forebyggingen kan forekomme under befruktningsprosessen eller etter befruktning. Uansett, til slutt skaper det en barriere for å produsere et fruktbart avkom som kan føde et annet fruktbart avkom. Blant de forskjellige mekanismene er geografisk isolasjon en faktor for reproduktiv isolasjon.
