Nøkkelforskjell - Exome vs Transcriptome
Et gen inneholder kodende og ikke-kodende regioner i det. Kodende sekvenser er kjent som eksoner, og ikke-kodende sekvenser er kjent som introner. Nukleotidsekvensen til eksonene til et gen representerer genetisk kode for genet for å syntetisere det spesifikke proteinet. Derfor forblir eksoner i mRNA-molekylet. Den totale eksonregionen i genomet er kjent som exome, og det er en viktig del av genomet. Genenes genetiske kode blir omdannet til den genetiske koden til mRNA-molekylet, som er nødvendig for produksjon av protein. Hele mRNA-molekylene transkribert i en celle eller en cellepopulasjon om gangen er kjent som et transkriptom. Hovedforskjellen mellom eksom og transkriptom er at eksom representerer sekvensene av eksonregionene i genomet mens transkriptom representerer det totale mRNA for en celle eller et vev på et gitt tidspunkt.
INNHOLD
1. Oversikt og
nøkkelforskjell 2. Hva er Exome
3. Hva er Transcriptome
4. Sammenligning side om side - Exome vs Transcriptome
5. Sammendrag
Hva er Exome?
Gener er sammensatt av eksoner, introner og regulatoriske sekvenser. Eksoner er genregionene som transkriberes til mRNA-sekvens under transkripsjonen. Introns og andre ikke-kodende regioner fjernes under transkripsjonen. Nukleotidsekvensen til eksoner bestemmer den genetiske koden til genet som syntetiserer det spesifikke proteinet det koder. Bare eksoner forblir innenfor mRNA for et protein. Samlingen av eksoner i genomet er kjent som eksom av en organisme. Det representerer en del av genomet som uttrykkes i gener. Hos mennesker utgjør exome 1% fra genomet. Det er den proteinkodende delen av det menneskelige genomet.
Figur 01: Exome
Hva er Transcriptome?
Transkriptomet er samlingen av alle proteinkodende og ikke-kodende transkripsjoner (RNA) i et gitt vev. Transcriptome representerer samlingen av totale mRNA-molekyler uttrykt av genene i en celle eller et vev. Transkriptomet til en celle kan varieres med transkriptomet av en annen celletype. Transkriptomet er også dynamisk - det endres med tiden som respons på både interne og eksterne stimuli. Selv i samme vev eller i samme celletype kan transkriptom endres etter få minutter.
Transcriptome skiller seg fra exome av en organisme. Transcriptome inkluderer bare de uttrykte eksomsekvensene. Selv om eksome av en celle forblir den samme, er transkriptom forskjellig mellom celler siden genuttrykk ikke er det samme for alle celler eller vev. Bare essensielle gener uttrykkes i forskjellige celler og vev. Genuttrykk er en vevs- eller celletypespesifikk prosess. Det reguleres av ulike faktorer, inkludert miljøfaktorer. Derfor kan transkriptom variere med eksterne miljøforhold.
Transcriptome brukes som en forløper for proteomikkstudier. Alle proteiner er avledet fra mRNA-sekvenser. Translasjonsmodifikasjoner kan føre til endringer i proteiner. Imidlertid gir transkriptom viktig grunnleggende informasjon for proteomiske studier.
Figur 02: Transkriptom av embryonale stamceller
Hva er forskjellen mellom Exome og Transcriptome?
Diff Article Middle before Table
Exome vs Transcriptome |
|
| Exome er samlingen av proteinkodende region av genene. | Transcriptome er samlingen av alt transkribert RNA inkludert mRNA. |
| Prøve | |
| Exome studeres ved hjelp av DNA-prøve. | Transkriptom studeres ved hjelp av en RNA-prøve. |
| Studiemetode | |
| Hele exome-sekvensering er metoden for å studere exome. | RNA-sekvensering er metoden for å studere transkriptom. |
Sammendrag - Exome vs Transcriptome
Eksoner er kodingssekvensene til genene og bestemmer mRNA-sekvensene til proteinene. Samlingen av disse kodende sekvensene (eksoner) er kjent som eksom av en organisme. Gener transkriberes til mRNA-molekyler før de produserer proteiner. De totale mRNA-molekylene til en celle eller et vev til enhver tid er kjent som transkriptom. Transcriptome representerer gener som til enhver tid blir aktivt uttrykt i mRNA. Transkriptom er celle- og vevsspesifikt og påvirker med miljøforholdene. Dette er forskjellen mellom exome og transcriptome.
