Hovedforskjellen mellom snRNA og snRNP er at snRNA er små kjernefysiske RNA-molekyler mens snRNP eller små kjernefysiske ribonukleoproteiner er små kjernefysiske RNA-molekyler med proteiner.
snRNA er ikke-kodende, biologisk aktive små RNA-molekyler med en gjennomsnittlig størrelse på 150 nukleotider. De er vanligvis tilstede i forbindelse med proteiner som snRNP i naturlig tilstand. Derfor er snRNPs lite kjernefysisk RNA med flere snRNP-spesifikke proteiner. snRNPs er involvert i mediering eller regulering av posttranslasjonelle RNA-prosesseringshendelser som spleising, etc. Både snRNA og snRNP finnes i kjernen til eukaryote celler.