Hovedforskjellen mellom NMR og røntgenkrystallografi er at NMR er en analytisk teknikk som brukes til å bestemme typen og antall atomer i et organisk molekyl, mens røntgenkrystallografi er en analytisk teknikk som brukes til å bestemme atom- og molekylstrukturen til en krystall.
Begrepet NMR står for kjernemagnetisk resonans. Dette begrepet kommer under subtopisk spektroskopi i analytisk kjemi. Røntgenkrystallografi er derimot en type krystallografisk teknikk der vi bruker en røntgenstråle for analyse av krystaller.