Hovedforskjellen mellom kodominans og flere alleler er at kodominans uttrykker effekten av begge alleler uavhengig, uten å blande seg i den heterozygote tilstanden, mens flere alleler refererer til tilstanden til et trekk som har mer enn to forskjellige alleler.
Vanligvis kommer hvert gen med to forskjellige alleler. Den ene er en dominerende allel mens den andre er en recessiv allel. I henhold til arv fra Mendel uttrykker dominerende allel fenotypen mens den undertrykker den recessive allelen i heterozygot tilstand. Imidlertid har noen gener tre eller flere forskjellige alleler for ett trekk. De kalles flere alleler. Videre er kodominans en ikke-mendelsk arv. I dette fenomenet får avkom begge foreldrenes gener som en kombinasjon av begge genene. Derfor uttrykkes begge gener likt i avkommet.
