Hovedforskjellen mellom ionotrope og metabotrope reseptorer er at ionotrope reseptorer tillater binding av ioniske ligander til dem som åpner ionekanalen. I mellomtiden tillater metabotrope reseptorer binding av kjemiske ligander til reseptorene, og initierer en kaskade av reaksjoner via kobling med et G-protein.
Signaltransduksjon og membrantransport er viktige prosesser i biologien. Begge spiller en viktig rolle i reguleringen av stoffskiftet i systemet. Størstedelen av metabolske veier og membrantransport finner sted gjennom reseptorer som binder med ligander, som enten kan være ioniske ligander eller kjemiske ligander.