Hovedforskjellen mellom mycoplasma og chlamydia er at mycoplasma er en slekt av bakterier som mangler en cellevegg, mens chlamydia er en slekt av bakterier som inkluderer gramnegative og obligatoriske parasitter.
Mycoplasma-arter er de minste bakteriene som har blitt oppdaget ennå, med de minste genomene og et minimum antall svært essensielle organeller. Mycoplasma er veggløse bakterier. Derfor har de ikke en bestemt form. Generelt er de sfæriske til trådformede celler. Derimot er klamydia en slekt av bakterier som har cellevegger. De er gramnegative bakterier. Både mycoplasma og chlamydia forårsaker seksuelt overførbare sykdommer. Videre gir de lignende symptomer, men de kan behandles med forskjellige antibiotika.
