Hovedforskjellen mellom intracellulær og intercellular signalering er at intracellular signalering er kommunikasjonen i cellen mens intercellular signalering er kommunikasjonen mellom celler.
Celler frigjør signalmolekyler for å målceller og kommuniserer med hverandre via signalmolekyler i flercellede organismer. Målceller har reseptorer på celleoverflatene og i cytoplasmaet for å motta signaler og handle deretter. Også i cellen skjer kommunikasjon mellom organeller og kjerne for å utføre cellulære funksjoner. Derfor er det to typer cellekommunikasjon som intracellulær signalering eller kommunikasjon og intercellulær kommunikasjon eller signalering.
