Hovedforskjellen mellom karyotype og idiogram er at karyotype er det faktiske bildet av totale kromosomer i en celle mens idiogram er et skjematisk diagram av en karyotype som illustrerer alle kromosomkart.
Et sett med kromosomer representerer genomet og den genetiske informasjonen til en organisme. Hvert kromosom har en unik form, størrelse og et sett med gener. Antallet og fysiske strukturer av kromosomer avslører viktig informasjon om organismen. Karyotyping er en teknikk som utføres for å undersøke hele settet med kromosomer i en celle. Totale kromosomer samles og analyseres under denne testen for å avgjøre om det er numeriske eller strukturelle abnormiteter i kromosomer. Det faktiske bildet som viser de totale kromosomene i en celle er karyotypen, mens skjematisk diagram over de totale kromosomene i en celle er idiogrammet. Begge er viktige i cytogenetiske studier.
