Hovedforskjellen mellom hagle-sekvensering og neste generasjons sekvensering er at hagle-sekvensering er en sekvenseringsmetode som tilfeldig bryter opp DNA-sekvenser i mange små fragmenter og monterer sekvensen på nytt ved å observere de overlappende områdene mens neste Next Generation Sequencing (NGS) er en avansert metode for genetisk sekvensering som avhenger av kapillær elektroforese.
Sekvensering er prosessen som bestemmer den nøyaktige rekkefølgen av nukleotider i et gen, en klynge av gener, kromosom og et komplett genom. Det er veldig viktig i genomstudier, rettsmedisinske studier, virologi, biologisk systematisk, medisinsk diagnose, bioteknologi og i mange andre felt å analysere strukturen og funksjonen til gener og identifisering av organismer. Videre er det forskjellige typer sekvenseringsmetoder tilgjengelig. Shotgun Sequencing og Next Generation Sequencing er to avanserte metoder blant dem.
