Hovedforskjellen mellom hierarkisk og helgenoms haglgeværsekvensering er at i hierarkisk haglegeværsekvensering blir genomet brutt opp i større fragmenter før sekvensering, mens hele genomet er fullstendig brutt opp i små fragmenter for sekvensering.
Sekvensering er en viktig teknikk i molekylære prosesser, spesielt i nøyaktig identifikasjon av arter. Faktisk er det teknikken for å identifisere den nøyaktige rekkefølgen av nukleotider i et gen eller et genom. Det er mange teknikker for sekvensering. Noen av disse inkluderer Maxam Gilbert-metoden, Sanger-metoden og den automatiserte Sanger-metoden.
