Hovedforskjellen mellom MRSA og MSSA er at MRSA står for meticillinresistent Staphylococcus aureus med referanse til stammer av Staphylococcus aureus som er resistente mot β-laktamantibiotika, mens MSSA står for meticillin-sensitiv Staphylococcus aureus som refererer til stammer av Staphylococcus aureus som er utsatt for β-laktamantibiotika.
Meticillin er et smalt spektrum β-laktamantibiotikum som hjelper til å bekjempe bakterielle sykdommer. Staphylococcus er en slekt av bakterier som forårsaker hudinfeksjoner, blodforgiftning, lungebetennelse og andre infeksjoner. Noen stammer av Staphylococcus aureus er resistente mot en rekke β-laktam-antibiotika. Begrepet som refererer til disse resistente stammene er "Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus" eller MRSA. På den annen side er noen stammer av Staphylococcus aureus følsomme eller utsatt for disse β-laktamantibiotika. Begrepet som brukes for å referere til denne gruppen av bakterier er "Methicillin-Sensitive Staphylococcus aureus" eller MSSA.