Hovedforskjellen mellom alfa- og beta-hydroksysyrer er at alfa-hydroksysyren (AHA) har en karboksylsyregruppe og en hydroksylgruppe atskilt med ett karbonatom, mens en beta-hydroksy-syre (BHA) inneholder en karboksylsyregruppe og en hydroksylgruppe separert av to karbonatomer.
Hydroksysyrer er organiske forbindelser som begge har en karboksylsyregruppe og en hydroksylgruppe i det samme molekylet. Karbonatomer som disse funksjonelle gruppene er festet til er i nærheten. Derfor kan vi kalle dem som alfa, beta eller gamma, i henhold til antall karbonatomer som skiller disse funksjonelle gruppene. La oss diskutere flere detaljer i teksten nedenfor.