Hovedforskjellen mellom alfa- og beta-anomerer er at i alfa-anomer er hydroksylgruppen ved det anomere karbon cis til det eksosykliske oksygenet i det anomere senteret, mens i beta-anomer er hydroksylgruppen trans til det eksocykliske oksygenet.
En anomer er en geometrisk variasjon blant karbohydrater. Det er en type epimer der vi kan se et anomert karbonatom. Et anomert karbonatom er avledet fra karbonylkarbonet i den åpne kjedestrukturen i karbohydratet. Derfor kalles dannelsen av den sykliske strukturen fra den åpne kjedestrukturen anomerisering.