Hovedforskjellen mellom antigen og antistoff er at antigen er ethvert stoff som induserer immunforsvaret til å produsere antistoffer mot det mens antistoff er et Y-formet immunoglobulinbeskyttende protein som er i stand til å binde seg til antigener for å nøytralisere dem.
Kjerneforståelsen av immunologi, så vel som noen aspekter av mikrobiologi, patologi og dermatologi, er avhengig av forståelsen av de grunnleggende begrepene antigen-antistoffreaksjoner. Dette er byggesteinene til store kunnskapsgrunnlag og nyutviklede teknologier for å bekjempe forskjellige mengder sykdommer.