Hovedforskjellen mellom hyaloplasma og cytosol er fravær og tilstedeværelse av celleorganeller. Hyaloplasma består av strukturløs væske mens cytosol består av væske og strukturerte organeller.
Hyaloplasma og cytosol er organiske væske stoffer som finnes i en celle. De kan observeres i prokaryote celler i tillegg til eukaryote celler. Hyaloplasma refererer til den flytende delen av cytosolen, som ikke består av noen strukturer. Til sammenligning er cytosol en flytende fase som består av strukturelle komponenter i en celle bortsett fra kjernen.