Hovedforskjellen mellom gjødsel og organisk materiale er at gjødsel er en form for organisk materiale som er menneskeskapt mens det organiske stoffet er de karbonrike forbindelsene som dannes naturlig i jorden.
Planter er de viktigste hovedprodusentene i våre økosystemer. Derfor er de viktige for å levere mat til andre dyr og deltar også i å opprettholde den naturlige likevekten. Planter trenger også mat og vann for å vokse. De er avhengige av jorda for mat, vann og habitat. Derfor må jorden være i sunn tilstand, og organisk materiale er nødvendig for å opprettholde jordens kvalitet. Organisk materiale er forbindelsene som inneholder karbon. I jord er det mange former for organisk materiale. I motsetning er gjødsel menneskeskapt og inneholder alle viktige næringsstoffer som kreves for å øke jordhelsen. Følgelig er organisk materiale og gjødsel to terminologier som er veldig viktige i jordbiologi og jordbruk.