Hovedforskjellen mellom somatisk variasjon og germinal variasjon er at somatisk variasjon er den genetiske variasjonen som forekommer i somatiske celler, mens germinal variasjon er den genetiske variasjonen som forekommer i kimceller som egg eller sædceller.
Genetisk variasjon refererer til prosessen med å endre det genetiske materialet til en organisme eller forskjellen i DNA-sekvenser mellom individer i en populasjon. DNA-sekvenser kan endres med tiden i en generasjon til generasjon. Genetisk rekombinasjon er en av hovedmekanismene som forårsaker genetisk variasjon. Videre kan mutasjon også forårsake genetisk variasjon. Genetisk har flercellede organismer to hovedtyper celler; somatiske celler og kimceller. Derfor er genetisk variasjon av to typer; de er den somatiske variasjonen og germinalvariasjonen. Hvis den genetiske variasjonen forekommer i somatiske celler, kaller vi den en somatisk variasjon, og hvis den genetiske variasjonen forekommer i kimcellene, kaller vi den germinal variasjon. Somatiske variasjoner er for det meste ikke-arvelige mens germinalvariasjoner for det meste er arvelige.