Hovedforskjellen mellom kunstig embryo-tvilling og somatisk cellekjerneoverføring er at kunstig embryo-tvilling er teknikken der splitting av et befruktet egg i to genetisk identiske embryoer foregår under in vitro-forhold mens somatisk cellekjerneoverføring er en teknikk der innsetting av en somatisk cellekjerne i en enucleated eggcelle finner sted under in vitro forhold.
Molekylær kloning er en viktig teknikk for å produsere rekombinante organismer med forbedrede tegn. Kunstig embryo-tvilling og somatisk cellekjerneoverføring er to slike teknikker som brukes under in vitro-forhold for å skape kloner for både reproduktive og terapeutiske formål. Imidlertid er det en forskjell mellom kunstig embryo-tvilling og somatisk cellekjerneoverføring når det gjelder kloningsmetoden.
